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教授選の激しい攻防が見ものだった第一部から一転、この第二部では教授の座に上り詰めた財前（唐沢寿明）が患者の遺族に訴えられる医療過誤裁判を中心にドラマは展開していく。佐々木庸平（田山涼成）の術後の病状に不安を抱いた柳原（伊藤英明）から何度となく診察を請われるも、教授就任の有頂天の心持ちに加えて、ポーランドで開かれる国際外科医学会の準備に忙しい財前はそれどころではない。日本を飛び立った財前はワルシャワでも完璧な執刀ぶりを見せつけ、ポーランドの医師たちをうならせる。時を同じくして、里見（江口洋介）から佐々木庸平の容態が悪化していることを知らせるメールが届いていた。
裁判をめぐって